8月15日：
美琴与御坂9982号相遇，随后得知“绝对能力者计划计划”真相的美琴与一方通行第一次相遇并进行对决，惨败。
8月16、17、18日：
美琴为了阻止计划、对研究者进行报复而去摧毁二十多所研究所。
8月19日：
美琴在袭击水穗机构病理解析研究所时被ITEM组织中的弗兰达埋伏并展开战斗，打败了弗兰达后与NO.4“原子崩坏”麦野沈立开打，险胜之后脱离。
8月20日：（第三卷开始）
当麻被贩卖机吞了2000元之后，先后遇见美琴、黑子、和御坂10032号，发现美琴的异常。
8月21日：
辅导日的最后一天，上条当麻在大铁桥阻止打算赴死的美琴，为了拯救藉由美琴的DNA情报诞生的复制人御坂妹妹们，向学园都市最强的超能力者一方通行挑战。最后，上条将一方通行打倒，实验由此遭冻结，之后当麻再次住院（第三卷开始结束）
8月22日：
在探病上条的过程中，美琴由于当麻的一句“饼干还是亲手做的比较好”而内心动摇。为送给上条自己亲手做的饼干，但又要避免太引人注目，为此来到佐天泪子的宿舍烤制饼干。但当真的遇到上条时美琴却只顾脸红心跳，饼干最终也没能送出去。
8月28~29日：（第四卷）
AngelFall（“天使坠落”）事件，当麻再再次入院
8月31日：（第五卷开始）
凌晨当麻发现暑假作业没做，白天假扮美琴男友。后与假海原光贵战斗并击败之，与其约定守护美琴。
②一方通行遇到Lastorder（最后之作），并摧毁天井亚雄阴谋拯救她，和芳川一起受重伤入院抢救。
③下午暗咲逢魔入侵学园都市，袭击当麻和Index，绑架Index，当麻前去营救发现暗咲是为了救受诅咒的爱人，当麻表示愿意和他出去用自己右手破除诅咒。
9月1日：（暑假结束开学）
凌晨，芳川和一方通行手术成功（第五卷结束）
②（第六卷）凌晨暗咲逢魔和当麻强行离开学院都市，早上当麻回到学院都市开始新学期第一天，其后雪莉·克伦威尔侵入学园都市、风斩冰华事件
9月8~9日：（第七卷）
“法之书”事件
9月第三个星期五（9月13日）：
美琴尝试入侵书库，被初春发现将资料加密阻止其入侵
9月14日：（第八卷）
树形图设计者残骸争夺事件
9月19~25日大霸星祭：（第九、十卷）
9月19日：
大霸星祭第一天，当麻和御坂美琴做出“惩罚游戏”的约定
②“使徒十字”事件
9月20日：
大霸星祭的第二天，从佐天泪子和索绮特的对话中得知暗部组织“人员（Member）”及黑幕木原幻生的真正目的是御坂美琴后，迅速赶往第二学区的研究设施“才人工房”解救御坂美琴。
9月25日：（第十一卷开始）
“不幸的”当麻居然抽中奖去意大利旅游7天。
9月27日：
当麻和Index到达意大利北部，碰到奥索拉和天草式，之后卷入“女王舰队”事件，阻止罗马正教阴谋并救出修女部队，当麻受伤被高科技飞机送回学园都市接受治疗（第十一卷结束）
9月30日：（十二卷）
美琴的惩罚游戏
②（十三卷）前方之风侵入学院都市，杀死3名理事会议员，造成大量学生和警备员陷入昏迷，事件过后成为了科学侧（学院都市与英国清教联盟）和魔法侧（罗马正教与俄罗斯成教联盟）爆发全面战争的导火索。
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